По какой стоимости фактической или кадастровой будут считать 13%налог. и сколько это будет для каждого.

Кто будут?
вы и будете считать.
у вас обязанность подать декларацию раз проданное у вас менее трех лет в собственности, заявить доход, применить стандарт. налог вычет имеете право. посчитать остаток и с него 13% ндфл.
доход 2250 тыс. руб . какой доход у каждого собственника доли, нам неизвестно, ибо неизвестно, что там в договоре было, нам неизвестно. равная ли цена за равные доли по договору продажи квартиры.
продавали вы по одному договору квартиру за эту сумму,
или отдел. доли по отд. договорам.
если бы имели привычку консультиров. с юристами до соверш. юрид. значимых действий,
то продали бы долю каждый по отд. договору за 1125 тыс. руб и каждый заявил бы вычет 1 млн. и в итоге каждый заплатил бы ндфл только со 125 тыс руб. по 16250 руб.
а вы продали по одному договору за 2250 тыс. станд. вычет 1 млн делится между вами поровну по 500 тыс.. значит у каждого доход 1125 тыс - вычет 500 тыс=625 тыс., а с 625 тыс 13 % это 81250 руб. ндфл с каждого.
на кадастровую плевать, ваш доход в договоре.