Много лет не получаю налоговое уведомление на квартиру и не плачу налог - там не бываю, прописана по другому адресу.

Бегать должны они, если вы в квартире, которая в собственности, не зарегистрированы и не были на момент оформления (то есть в регистрационном деле указан ваш реальный адрес, где зарегистрированы), то это их косяк однозначно - налог платить придется полностью, а от пени отобьетесь. правда, они могут подать заявление на выдачу судебного приказа, но он отменяется просто по заявлению о несогласии с ним, платить долг для отмены не обязательно. в общем, смотрите сами - если сумма налога ежегодная небольшая, то и не дергайтесь, пусть налоговая свои обязанности исполняет.