Покупая, как физ лицо у юрлица нежилое помещение, могу ли я дать ему всю сумму наличными?

Не советую. или заключайте договор у нотариуса - он проверит подлинность документов организации. передача денег только через банковскую ячейку.
1. наличные расчеты организации ограничены суммой 100 000руб. (положение цб о кассовом обслуживании)
2. организация не может давать расписки, даже если директор будет действовать по доверенности от имени ооо. даст пко (приходно-кассовый ордер) с печатью организации.
3. организация уходит от уплаты налогов.