Должен ли ип платить налоги в том квартале, в котором он выставил счет-фактуру

Здесь не только расчет надо учитывать Моментом определения налоговой базы по НДС 1) день отгрузки (передачи) товаров (работ, услуг), имущественных прав; 2) день оплаты, частичной оплаты в счет предстоящих поставок товаров (выполнения работ, оказания услуг), передачи имущественных прав. Если Вы отгрузили товар и одновременно выставили счет-фактуру, то обязаны уплатить НДС не дожидаясь оплаты.