У организации, где работаю, взял ссуду. Каким способом сохранив за собой задолженность я могу уволиться?

Это совершенно разные правоотношения. вы всегда можете уволится по собственному желанию, ст.80 ТК РФ, письменно предупредив работодателя за 2 недели. деньги останетесь должны...