Смогу ли я получить вычет налога при покупке квартиры если я индивидуальный предприниматель.

Это зависит от вида деятельности и применяемой системы налогообложения. Если Вы используете общую систему налогообложения, то да - в общем для всех порядке, так как в этом случае Вы являетесь плательщиком налога на доходы физических лиц (подоходного) по ставке 13 %. Если Вы применяете ЕНВД, УСНО, ЕСХН, то от уплаты налог на доходы физических лиц (подоходного) Вы освобождены. В этом случае вычет применять не к чему - следовательно, нет.