Вызывают на допрос в налоговую.

Вы здесь при том, что налоговая инспекция имеет право опросить (не допросить, а опросить) в рамках проведения любой проверки любого, кому по их мнению может быть что-либо известно о проверяемом лице. а в данном случае вы - не просто любой, а человек, который прямо контактировал с интересующей налоговиков фирмой.
ничего страшного в этом нет: придете и побеседуете с инспектором. если действительно "касались краем" - никаких последствий для вас эта беседа иметь не будет.
если использовалась общая система налогообложения и вы предоставили на проверку декларацию по ндс, то вопрос мог возникнуть и в рамках проверки вашей же декларации. какой именно, зависит от того, с какой стороны вы с этой фирмочкой "работали" - это поставщик или покупатель.
не сданная этой фирмой декларация в таком случае - это несоответствие между данными вашей декларации и их: если фирма покупатель - "потерялась" часть вашей реализации, а если поставщик - часть ваших вычетов. в последнем варианте налоговый орган может не принять к вычету расходы, связанные с закупками у той фирмы, т. е. доначислить ндс вам.

теперь о последствиях.
вызов свидетеля и проведение опроса - это вполне законный способ проведения налогового контроля. вызов на опрос производится письменно заказным письмом. вы, конечно, можете его не получать фактически, но такие письма, направленные по адресу постоянной прописки, все равно считаются полученными на 6-ой рабочий день после отправки. так что неполучение письма на почте на наложение штрафа за неявку никак не поможет.
необоснованная (без уважительных причин) неявка на опрос - это налоговое нарушение, за которое положен штраф в размере 1000 рублей.