Имеет ли право предприниматель, работающий по патенту, на получение возврата налога 13% при покупке недвижимости?

Нет, не имеете.
и не имеет значения, куплен ли участок от имени ип или от "просто физического лица". значение имеет тот факт. что вы "работаете на патенте".
а теперь подробнее.
возврат 13 % при покупке недвижимости производится не сам по себе. это не субсидия. это налоговый вычет, который работает очень просто: он в натуральном смысле в ы ч и т а е т с я из доходов (уменьшает их), в связи с чем сумма налога становится меньше, чем если бы он рассчитывался со всего дохода. возвращается именно эта самая разница.
причем связан этот вычет не со всяким налогом, а с вполне определенным - с налогом на доходы физических лиц (его у нас по привычке называют подоходным).
следовательно, если налог на доходы физических лиц не уплачивается, применять вычет не к чему. нельзя взять из кошелька (бюджета) то, что ты туда не клал.
ип на патенте в бюджет уплачивает один налог - оплачивает сам патент. при этом он от уплаты других налогов освобожден. в том числе и от подоходного налога со своих предпринимательских доходов. следовательно, нечего возвращать - вы не платите в бюджет тот налог, в котором имущественный вычет применяется.

вот если у вас есть другие доходы (не связанные с предпринимательской деятельностью) - например, вы параллельно работаете и получаете официальную зарплату, - тогда право на вычет есть. но только, повторюсь, на те доходы, которые вы получаете именно как физ. лицо и с которых уплачиваете в бюджет налог в размере 13 %.