Нужно ли платить налог?

Здравствуйте. после долгих судебных дел. отцу и его коллегам дали по комнате в трех комнатной квартире в 2008 году. в 2009 году они продали свои комнаты одновременно, покупателями были муж и жена. продали в общем за 1 950 000 руб. за комнату все продавцы получили по 650 000.
получается, что комната была менее 3 лет в собственности. продал отец ее за 650 000. в свидетельстве о государственной регистрации права вид права: общая долевая собственность 1/3. у нас есть расписка на сумму 650 000. но договор купли-продажи составлен не индивидуально на каждого, а на троих сразу. при этом прописана общая сумма 1 950 000. и просто указанно что продавцы получат деньги от покупателя на счета в банке. банк этот давно закрыт. выписок с банка ни каких нет. в 2010 пришло письмо с налоговой что нужно подать декларацию и заплатить налог. что отец и сделал. в декларации указали общую сумму дохода 650 000 общую сумму расходов и нал вычетов 333 333.33 руб. налоговая база 316 666.67 руб. общая сумма к уплате налога составила 41 167.
помогите разобраться нужно было платить или нет. если нет то на какие документы ссылаться и как правильно написать заявление.... и какие документы приложить.