Должен ли платить налог, если квартира менее 3лет, но продаю за ту же сумму, что и покупал через 2 года?

Налог в вашем случае будет равен нулю.
однако декларацию вам подать все равно придется - до 30 апреля 2015 года, причём к декларации нужно будет приложить копии документов, подтверждающих, что квартира куплена именно за такую цену.