2 ндфл для сотрудника в электронном виде, возможно ли?

Технически и технологически - возможно. запись на флешку. законодательно (по инструкции) - на бумажном носителе.
а вот предоставление 2ндфл - сторонним лицам - запрещено.
остаётся лишь добрым словом упросить помочь вам вашего бухгалтера и выслать справку на ваше имя на факс.. . номер.. . можно и того именно банка. и с самим банком договориться, что именно вам отдают ту справку и вы рядом стоите ожидая ту справку и тут же по телефону вы подтверждаете что именно вы получаете факс.
скан копию высылать по факсу же. по скайпу - проблемнее, да и скайпы с функцией распечатки программных документов не в каждом офисе есть... .
да и технологические операции высылки по скайпу не каждому бух-у известны.